Ai sensi del d.l. 98/2011, convertito con legge 111/2011, l'Indire è stato articolato in:
| cinque nuclei territoriali interprovinciali | |
| 3 nuclei territoriali interregionali | |
| 18 nuclei territoriali regionali | |
| un nucleo territoriale per ciascuna Regione e Provincia autonoma |